一、隐秘工程审计的注意事项
(一)不断提高工程审计人员专业素质，加强相关专业的学习
审计人员不但应该对财务会计知识精通，而且还应该广泛学习工程施工技术、工程造价和项目管理等方面的专业知识。加强与工程管理部门的交流，积极参加相关工程部门组织的各种培训，不断更新自身的专业知识，积累经验，只有这样，才能在隐蔽工程审计中准确发现问题线索。
(二)认真搞清施工单位的核算方式
审计前要充分了解施工单位的资金物资的核算方式，各个管理部门的职责，特别是关键环节，如财务管理的流程，工程物资的购买、领用和支出管理，工程量的计量，合同的管理等。只有对隐蔽工程施工中涉及到的这些情况摸清后，才能准确确定施工单位的成本，发现其是否偷工减料，是否高估冒领建设资金。
(三)选准重点，精心审计
审计人员在对隐蔽工程进行审计时，应当遵循这样的原则，即选取工程量和资金大的以及对工程质量有重大影响的隐蔽工程作为重点，核对所耗用的一种或几种材料数量时，材料量应当较多，金额较大，不能被代替，属于构成工程实体的材料，并且该材料用量在设计上是有明确要求的，不能随着施工工艺、施工程序的不同而不同。
二、隐秘工程审计的特点
(一)审计可查验性难
隐蔽性是隐蔽工程最为显著的特点，工程完工后，隐蔽工程被其他分部分项工程所遮盖，再对其进行检查检验就非常复杂和困难，需要对覆盖工程破坏后，才能检查，检查结束后，还要进行复原，需要发生一定的费用，审计人员只能采用抽检的办法，因此给审计人员的查验核实造成很大困难。往往审计人员只能通过查阅工程资料、财务凭证和延伸相关材料供应商等间接方式发现存在的问题线索。
(二)审计滞后性
隐蔽工程的监督具有时限性，而审计人员不可能伴随施工过程常驻工地，对隐蔽工程进行现场实时监督，一般是工程完工后进行审计，因而对隐蔽工程的审计只能是事后根据相关资料进行查验，相对于隐蔽工程施工审计具有一定滞后性。