一、工程财务审计收取费用的标准
1、只委托做初步设计或施工图设计时，按照行业划分设计工作量各占的比例并乘以1.1的系数计算收费。如果增加编制施工图预算，按工程设计收费标准乘以1.1系数计算收费。
2、工程设计中采用标准设计（标准构配件图除外）、复用设计，按同类新设计项目的20%收费。
3、进行工程技术咨询服务，参加规划调查、询价、报价、对外谈判等技术服务工作，以及没有制订具体收费标准的工作，可采用按直接生产人员工日计算收费的办法，收费标准为每工日85元。工曰的计算可执行工日定额或由设计方和委托方根据任务情况在签订合同时协商确定。需要到外埠出差，工期在六十天以内的任务，其差旅费由委托单位负担，工程设计单位由于所承担任务的需要而出国时，除制装费由设计单位支付外，其他出国费用（包括外汇额度）均应由委托单位支付。
4、收费标准中考虑了各种影响设计工作量因素的调整系数，如果在同一项目中的两种以上因素同时存在，由该项目总的调整系数应为各单项调整系数小数点以后数字之和再加1,但总的调整系数最高值不得大于1.5.
5、按实物或工日定额计取设计费的，凡投资在3亿元以上的项目，其费额最高不得大于概算比例的1.5%.
6、有较好的经济效益，经设计审查确认，可由上级主管审查部门决定，适当增加设计费，一般控制在设计费的10%以内如果设计质量和技术水平达不到合同要求的，应按合同规定扣减设计费。
7、设计费按设计进度分期拨付。设计合同生效后，委托方应向设计单位预付设计费的百分之二十。
二、工程审计是如何进行的
1、看图法
2、观察法
3、询问法
4、调查法
5、开挖法
6、分析法
7、测量法
8、核对法
三、工程审计的种类
工程审计包括两大类型：工程造价审计和竣工财务决算审计
造价审计一般是对单项、单位工程的造价进行审核，其审计过程与乙方的决算编制过程基本相同，即按照工程量套定额。这由造价工程师完成。
对于建设单位来说，由于造价审计只是审核单项、单位工程的合同造价，一个建设项目的总的支出是由很多单项、单位工程组成的，而且还有很多支出比如前期开发费用、工程管理杂费等是不需要造价审计的，所以还要有一个竣工财务决算审计，就是将造价工程师审定的，和未经造价工程师审核的所有支出加在一起，审查其是否有不合理支出，是否有挤占建设成本和计划外建设项目的现象等，来确定一个建设项目的总的造价。这由注册会计师完成。