在输水隧洞的除险加工施工方面主要包括三个部分：
第一部分是输水隧洞洞内的加固处理。即按照上述除险加固的设计方案拆除老的混凝土后，采用U型钢对隧洞的冒顶放段进行支撑，然后再进行钢筋混凝土的现浇，利用钢筋混凝土的现浇形成一道新的加固墙体结构保证输水隧洞的安全和稳定。同时，在进行工程的除险加固之前，需要对该工程的具体情况进行核实，收集隧洞容易受到雨水冲刷部分、水库的库容量、水文特征以及水力等相关数据。
第二部分是隧洞外的施工。在输水隧洞的洞外施工时，要按照大型集中、小型分散的布局原则对混凝土的搅拌、钢筋的加工以及其他的施工设施进行合理的布置。由于该水库输水隧洞所处的地质环境相对较差，因此，在洞外施工时，还需要对洞面进行挂网喷混凝土处理。
第三部分是塌方的预防。进行塌方的预防和处理时，要进行超前支护，锚杆支护的开挖时采用分段开挖的方式进行支护施工；在开挖爆破是要把握好爆破的强度和炸药的药量，合理的把握开挖的进度；另外，在塌方的预防方面还要左后施工前的排水，从而降低塌方的发生概率。