及时合理地处理工程合同变更具有重大的意义。
(1)促进合同管理的深化和细化，既保护承包商合理经济利益，又促使双方切实履行各自权利义务，确保工程造价合理。
(2)为承包商摆脱合同价偏低困境，扩大自身利润提供了机会，也为业主和监理单位进行管理和控制带来了很大的难度。因此，要做好工程合同变更的管理和控制。首先，监理单位应严格按照变更的处理程序和处理原则开展审查工作，确保变更工程项目、工程量和变更单价的合理性。其次，审查时，应对承包人的合同造价进行深入的分析和评估．确定该项目的成本以及承包人可能获得的预期利润，不仅加强单价合理性分析，而且加强对工程总造价的管理和控制，并注意由此引起的其他索赔和反索赔的可能性，确保工程总造价的公平合理。
(3)注重维护业主和承包人的合法权益，能促进工程的顺利实施。鉴于工程变更管理是施工过程合同管理的重要内容，工程变更常伴随合同价格的调整，是合同双方利益的焦点，因此，合理确定并即使正确处理好工程变更既可以减少不必要的合同纠纷，保证施工合同的顺利实施。