影响健康
临街大楼用作装饰的玻璃幕墙，就像一面大镜子，在日光较强时，其反射系数高达90%。它所反射的太阳光容易使身处其中的人们产生近视、疲劳、偏头疼、心动过速等疾患。对于驾驶员而言，更是容易头晕目眩、视觉错乱，以致引发以外交通事故。夏天，玻璃幕墙将阳光反射到居民室内，可使室温比一般民宅升高4-6℃，容易导致家用电器加剧老化。
火灾隐患
有些玻璃幕墙本身就潜伏着火灾隐患，尤其是那种凹形建筑物，其玻璃幕墙客观上形成一面巨型聚光镜。在深圳，曾经有一辆轿车停在某商厦附近，由于该商厦玻璃幕墙的聚焦作用，该车的车门橡胶密封条竟被烤化；在德国柏林还曾发生过因玻璃幕墙聚焦而引起火灾的发生。
放射性污染
有一些玻璃幕墙（如茶色的）含有一定的金属钴成分，其本身就是放射性元素，在阳光照射下更容易使人受到放射性污染，严重时会破坏人体的造血功能，引发癌症和其它疾病。有关人士指出，由于光污染不能通过分解、转化、稀释来消除，因此只能加强预防。
钢化玻璃自爆
幕墙钢化玻璃自爆是在无外力的作用下发生破裂，这是钢化玻璃的固有特性，大部分厂家产品的自爆率在3左右。钢化玻璃自爆的根本原因是因为玻璃中含有硫化氢及其他颗粒杂质，在玻璃被太阳照射，温度发生改变后，会产生膨胀，从而导致玻璃自爆。钢化玻璃的单片面积越大、结构越厚，自爆可能性越大。由于硫化镍在玻璃生产中不能完全杜绝，玻璃自爆被著名建筑师福斯特称为玻璃幕墙的癌症。钢化玻璃用在低层建筑上通常没有多大问题，但如果建筑高度达到5层，钢化玻璃自爆后的玻璃雨就会对人体造成伤害，如果建筑超过25层，玻璃碎片甚至可以击穿人的头盖骨。
在欧美等国，虽然没有法规禁止钢化玻璃的使用，但是业内却自觉形成规则：不用钢化玻璃。因为钢化玻璃尽管美观廉价（更为安全的夹丝玻璃价格约是钢化玻璃的两倍），但破碎后会导致碎片到处飞散。在玻璃幕墙应用广泛的日本，钢化玻璃只有在比较偏远的地区才能看到，在人群密集的闹市区，日本使用的还是夹丝玻璃或夹层玻璃，与钢化玻璃相比，夹层玻璃和低铁超白玻璃的安全性要高得多。夹层玻璃即使发生自爆，玻璃碎片仍可由夹层中的PVB膜维持成片状，不会洒落地面伤害行人。而低铁超白玻璃则不会自爆。日本没有硬性规定，但一切基于建筑物的安全功能要求进行设计、施工，是建设方基于对整个安全的责任。
玻璃幕墙 - 限制使用 欧美
欧美一些国家早在20世纪80年代末，就开始限制在建筑物外部装修使用玻璃幕墙，不少发达国家或地区甚至明文限制使用釉面砖和马克赛装饰外墙。在发现玻璃幕墙存在的诸多安全隐患和不够环保之后，美国出台《节约能源法》对玻璃玻璃使用提出限制；德国禁止使用大面积玻璃幕墙。发达国家转而寻找新型玻璃和技术，其中充氩双层低铁Low-e玻璃、变色玻璃窗因可调节室内温度而开始被使用，而铝合金框架和玻璃的结合也让玻璃幕墙变得更加安全。
中国
1996年建设部颁发的《玻璃幕墙工程技术规范》明确规定：玻璃幕墙大楼正常使用后每5年需进行一次全面检查；对玻璃、密封条、密封胶、结构硅酮密封胶等应进行检查。1997年施行的《上海市建筑物使用安全玻璃规定》也明确指出：幕墙安全玻璃使用满8年的，建筑物所有者或管理者应当委托有资格的技术鉴定机构进行查勘等。
2005年7月1日，中国才实施第一部《公共建筑节能设计标准》，开始对公共建筑的外窗可开启面积、玻璃幕墙占墙面的面积等提出具体限制标准。
2012年2月1日《上海市建筑玻璃幕墙管理办法》正式施行。根据新规，上海将禁止在T形路口正对直线路段的建筑物上采用玻璃幕墙；禁止住宅、医院门诊急诊楼和病房楼、中小学校教学楼、托儿所、幼儿园、养老院的二层以上建筑物采用玻璃幕墙。
新规还明确，已完成施工安装的既有玻璃幕墙，建筑物所有人即业主为使用与维护的责任主体。同时要求建立玻璃幕墙专项维修资金。