1.合同文件及解释顺序
在进行招标文件合同编制时，我们往往最为注意的是通用条款、专用条款、协议书、保修书、安全承诺、履约保函等合同文件。这样文件中的其他内容有可能被忽视，其中文件的解释顺序是工作人员最常忽略的问题，直至发生问题纠纷后才深知解释顺序的重要性，就为时已晚了，因此在编制合同时便思考其重要性便可防患于未然。
2.发包人和承包人的责任和义务
施工合同中，承包人的义务与责任包括以下几点：
(1)按照施工合同和设计文件严格施工；
(2)接受发包人的必要监督；
(3)按期完成和交付合格工程；
(4)保修责任和损害赔偿责任。
而在建设工程施工合同中，发包人的义务与责任则包括：
(1)按照合同约定做好施工前准备工作，提供原材料、设备、场地、资金和技术资料；
(2)与承包人相互配合，保证工程建设顺利进行；
(3)组织工程验收；
(4)接受建设工程并且按照约定支付工程价款。
3.工期延误
再出现工期延误后根据合同规定内容，分清双方责任。在合同中通用条款规定了部分延误工期的处理办法，专用条款中要注明发包方原因造成的工期延误的，承包人有权要求延长工期天数和/或增加费用，并由发包人支付合理利润；承包方原因造成的工期延误，按逾期竣工的违约金计算。通用条款中注明支付违约金也不能免除承包人完成工程及修补缺陷的义务。
4.验收方法和标准
在合同中须明确注明验收的时间及验收所用验收标准，防止在工程中出现验收方面的纠纷及概念模糊等现象的发生，保证工程按期按质完成。
5.质量、安全、环保、节能
质量、安全、环保、节能是国家一再要求的几个重要方面在投标中应当含有相关内容的协议。所以要求在合同中单独签订合同，或要求投标人在投标文件当中附加书面承诺，以此来确保工程质量等问题。
6.计量与支付
计量与支付招投标的双方都较为关注的问题，这两项与招标文件的报价方式联系极为紧密，对于投标人的报价其影响巨大。且这方面内容需在专用条件中提前约定的内容页较多。在其中需要注意以下几项：
(1)价款是否需要进行调整，若需要调整应当注明调整方向，这些都需要在合同中进行说明；
(2)合同中需注明工程款预付款的方式、数额及抵扣方式，除此以外还需表明付款方式；
(3)合同中要标明何时支付进度款，及各项进度需支付多少款项；
(4)保修金的比例和支付时间、方式。
7.材料、设备的供应
招标方需要提供的材料、设备都需要在合同中写明名称、规格、数量、单价和总价同时还要注明，材料差价、供货时间、供货方式及地点，并在合同中须注明运输所需费用、保管所需费用以及材料质量验收的标准，以此分清责任避免出现纠纷。最后还要明确安装工程责任人，在合同当中注明到底由哪一方进行材料的安装工作。
8．违约索赔
在建筑工程中很多情况在发生后都需进行索赔其中包括各种原因造成的工期延误；使用材料出现不合格或工程设备不合格造成工程返工的情况；施工出现缺陷，对其修复的情况；因某些原因造成的违约终止之后复工造成的费用。在合同违约条款中我们需注意，必须注明索赔对象，明确双方的责任，切忌不能只注意投标方责任而忽视了招标方过失。