一、工程结算审计流程
1、做好审计前准备工作。
（1）熟悉竣工图、施工图和各种合同文件；
（2）了解审计范围和采用标准；
（3）明确采用单价和调整原则。
2、选择合适审计方法，按相应内容计算。
由于工程规模不一，合同订立时间不一，施工企业不同，应对不同情况，采用不同审计方法进行审计。
3、综合整理审计资料，并与业主和承包商交换意见，立案后编制竣工预算书。
竣工结算审计，可以消除高估冒算，排除不正当提高工程预算造价现象，也有利于业主和承包商加强经费核算，提高经济效益，加强竣工结算审计，也是审计单位十分重要的工作之一。
二、工程结算审计和审核的区别
1、依据不同
项目管理单位审核的依据是工程承包合同，尤其是投标书单价、材料设备的价格及其组成，完成的工程数量及质量，工程变更、工程索赔以及工程进展期间双方履行合同的有关情况等。审计单位的审计依据是国家、地方有关部门颁发的各种财经制度规章、工程规范、定额、工程数量质量及各种手续和资料。
2、方式不同
项目管理单位审核是在工程从承包合同生效开始，直到工程竣工验收甚至保修阶段结束止。在工程各施工过程均按合同完成之后，将各期付款汇总并进行总体审查，该增的增，该减的减。期间与业主和承包人可以随时沟通。审计单位审计一般是在工程竣工验收之后，在项目管理单位对施工单位提交的竣工结算审核并签字的基础上进行的，对资料和实物进行核对，与被审计单位较少接触。
3、深度不同
项目管理活动贯穿于整个施工过程中，项目管理对工程中出现的各种现象能得到及时清楚的掌握，责任是非明确，亲自处理承包合同双方发生的争议，对合同的理解和掌握尺度比较得当，遇到工程量的增减、工程变更的价格、计量方法、索赔、反索赔等情况都能及时解决。这些情况反映到结算资料中，都能丝毫不差的表达出来，对隐蔽工程部分的工程量签证，项目管理单位完全掌握。审计单位只能以项目管理单位提供的资料作为主要凭据。
而资料的准确性主要取决于项目管理单位和承包人，审计结果是以他人提供的数据为依据。
4、依据不同
项目管理单位审核的依据是工程承包合同，尤其是投标书单价、材料设备的价格及其组成，完成的工程数量及质量，工程变更、工程索赔以及工程进展期间双方履行合同的有关情况等。审计单位的审计依据是国家、地方有关部门颁发的各种财经制度规章、工程规范、定额、工程数量质量及各种手续和资料。
三、工程结算审计质量的基本要求
工程结算审计质量是指工程结算审计工作的优劣程度。从广义角度看，它是指工程结算审计工作的总体质量，包括相应的管理工作质量和业务工作质量。从狭义角度讲，它是指工程结算审计业务工作的质量，包括审计准备、实施、报告等一系列过程的工作效果及达到审计目的的程度。本文的工程结算审计质量侧重于狭义理解，即工程结算审计业务工作质量。
工程结算审计质量的基本要求(或者衡量标准)，概括地讲就是应当符合国家审计机关、内部审计机关的准则和规范。从工程结算审计业务工作过程来看，其基本要求具体包括审计方案、审计行为和审计报告三个方面：
第一，审计方案是否切实可行。审计方案是基于审计目标确定的关于审计实施的计划，包括审计的范围、内容、方法、步骤及最终要达到的目标。编制审计方案应当充分考虑重要性和谨慎性。审计方案是否切实可行，决定了审计项目能否高质量地完成，最终决定了审计目标能否实现。
第二，审计行为是否合法规范。工程结算审计人员实施审计时，必须按照准则的要求，深入地调查、规范地取证、严谨地判断，并认真编制工作底稿。审计行为的合法性和规范性，直接影响着审计结果的有效性和审计质量高低。
第三，审计报告是否客观、完整、清晰、及时。工程结算审计报告，作为审计结果的主要表现形式，是否客观、完整、清晰、及时，将直接影响审计结果的利用效果和审计监督作用的发挥。
要保证工程结算审计质量，就需要实施工程结算审计质量控制，即通过一定的策略和措施，努力保证工程结算审计业务工作的质量符合其基本要求。