1、工程量清单计价在清单编制中存在的问题
计价规范本身的缺陷：由于《建设工程工程量清单计价规范》过于笼统和门类不全，清单项目远不能满足实际需要。
普遍感到费时费力：在工程量清单（及标底）的编制过程中，需分别按清单计价方式和定额计价方式来 计算 项目的工程量和套定额，即包含了两次算量（计算清单工程量、计算定额子目工程量）和两次定价（确定定额子目单价、确定清单综合单价），一定程度上造成了不必要的重复和浪费。
普遍存在的编制质量差问题：由于各种原因（如时间紧、编制人员素质低、粗心等）很容易造成工程量计算错误（或清单与定额的工程量混乱等）和定额套错；也存在清单的的项目特性描述与定额套取相互矛盾的情况；还有因清单和定额的工程量单位规定不统一，易在软件计算输入数据时因疏忽而造成错误。目前清单编制中存在问题较多的有：项目特征描述不清、工程量计算不准、漏项严重、清单编号与项目描述矛盾、清单编号混乱、工程量小数点位数计取错误等现象。
2、工程量清单计价在投标报价中存在的问题
仍存在大量的工程量计算：尽管工程量清单计价方式看起来很 科学 ，招标人算量、投标人报价，其实负责任的投标人还是需对招标人提供的工程量进行重新计算复核，一是为了确认待承接项目的实际工程量的准确数量，以利合理制定和安排施工方案，二是有利于采取必要的投标策略，对清单报价中的单价进行必要的调整。另外有的工程量不管投标人员有无责任心均必须要计算（如基础的垫层方量等），因此投标单位投标工作量未见减少。
仍按定额计算工程报价：实行工程量清单计价的目的在于打破由政府的造价管理部门统一单价的做法，让 企业 能充分发挥自己的价格和技术优势，但目前绝大多数施工企业根本没有企业定额。所以在进行工程量清单报价时，还是通过按照预算定额及相关规定来计算综合单价。这种做法的实质还是沿用传统的定额计价模式，只是表面形式的变换而已。
需考虑的因素更多、更累：由于工程量清单报价填的综合单价实际上是一个个的小预算，包含了利润和风险等因素，且非特殊原因单价是固定不变的，如有错也是一错到底，因此在报价时需考虑更多、分析更多。同样也存在报价中的费时费力和容易出错误的情况。
3、工程量清单计价在评标中存在的问题
由于工程量清单综合单价计算未要求投标企业按统一的现行定额进行报价，各投标企业可根据本企业的施工水平、技术机械装备情况、管理水平、设备材料的进货渠道及所掌握的价格情况等实际情况进行报价。上述原因可能会使各个投标企业的报价差异较大。如某投标企业采用了先进的施工工艺，节约了造价，但该企业可能会因有不合理低价而废标。
不平衡报价造成评标困难，一方面是不平衡报价过多，引起业主反感，是否定为废标有争议；另一方面业主的澄清调整困难，如招标人提供的工程量单位应为千克，而误为吨，属明确错误，而个别投标单位则采取不平衡报价，在评标时业主想澄清调整报价就会遭到部分投标单位的反对。4、工程量清单计价在合同签订中存在的问题
由于工程量清单的项目特征描述不够全面完整，选用的材料品牌规格不够明确、结算时可能的单价调整方式约定不够详细。使投标 企业 对项目的判断和综合价格的组成在理解上有误或差异。造成施工合同不能很好地满足合同双方的真实意思表现。
实行工程量清单招标以后，签订的合同为单价合同，不再把定额作为计价基础，主要以中标的投标单价为依据。但工程实际往往与清单描述有差异，对报价表中没有相应价格或需调整的价格，及索赔的价格等如何确定，很多施工合同未能详细约定，仅仅是模糊的几点原则，因此成为合同签订的一个重要问题。
工程量的错误或变更还会引起施工索赔纠纷，由于工程量清单的计价方式是将各种利润、管理费等计入综合单价中，
如工程量大幅减少，施工方会提出利润、管理费等不能同比例减少的要求；如增加的工程量/因此而增加的施工工期少于合同工程量/合同工期，则施工方又会提出增加现场管理费的请求。尽管施工合同一般约定工程量增加或减少超过15%时，综合单价予以调整，但如何调整也是工程结算时发生纠纷的起因之一。
工程量错误的不平衡报价及调高先付款项目调低后付款项目的不平衡报价等使承包人获取了超额利润，但同时也造成了业主的损失，不能体现合同的公平与合理。
5、工程量清单计价在结算审核中存在的问题
由于图纸变更及编制人员水平差等原因，经常会造成实际结算工程量与招标清单工程量相差较大，最终结算价与投标价相差甚远。
由于设计变更等原因造成原清单报价需作调整，一般的施工合同约定是在投标单价基础上按原报价水平及思路作调整，但也常常因原投标报价时综合单价存在错误而使调整后的综合单价错上加错。
由于编制人员的水平或责任心等原因，造成清单的项目特性描述不清或欠准确，造成理解上的差错，如特性描述中漏写部分说明，业主或审计单位一般会认为应按常规考虑，未详细列出的施工内容已经（或应该）包含在清单的综合单价中，而施工单位则会认为应严格按特性描述来考虑，应重新增加新的清单来补充原项目特性未描述的工作内容，从而发生不必要的结算纠纷。
措施费调整问题：工程量清单计价方式将措施费分列的目的是不限制投标人的施工方法，投标人在措施项目清单报价中可根据本企业的实际施工组织设计来 计算 措施项目，但结算时清单的工程量与投标时的工程量往往不一致，工程量的变化，措施费能否调整？如何调整？一直是结算纠纷的重点之一。有的施工合同虽明确注明措施费总价包干，不作调整，但在实际施工中如发生非施工方原因造成的措施费增加（特别是涉及费用较大的情况，如发现地下文物而增加保护措施）或因设计变更等引起工程量增加很多（如原造三层后改为造四层）造成措施费大幅增加的情况，如措施费不调整，也不合合同双方平等、公平的原则。
6、建议
及时调整更换清单计价规范，如《建设工程工程量清单计价规范》GB 50500-2008的实施，及时对原2003版存在的不足与缺陷进行了调整，完善了计价规范，造价行业管理机构加强对工程量清单编制质量的检查与督促；特别是对造价中介单位加强管理。
造价中介单位加强内部质量控制，严格遵守三级复核制度，最大限度地减少差错的出现。
避免招标文件编制仅有招标代理人员按套路进行编写，应有造价人员对项目的实际特性增加针对性的条款，加大结算调整的详细条款。措施费计算方式慎重斟酌。培养施工企业逐步建立企业定额。加强招标的严肃性，减少工程的变更和调整。
7、结束语
由于工程量清单计价的推行还处于起步阶段，存在各种各样的问题和困难是不可避免的，随着计价规范的不断调整修订，加上各级造价管理机构的专业人士和广大普通造价人员的共同努力，工程量清单计价方式一定能更做的更好。