1、工程资料综合管理
在水利工程施工过程中，设计图纸、竣工图纸等工程资料具有相当重要的指导作用。在水利工程完成后，工程资料也应当收集起来进行存档，并进行综合管理，以作为日后对水利工程进行维护、修缮的基础资料，在一定情况下部分水利工程的工程资料还需要进行分别建档和管理。良好的工程资料管理，不仅是水利工程规范性的体现，更是降低水利工程日后维护、修缮难度的重要资料，即使水利工程发生了重大损坏，施工人员也可以根据工程资料对其进行修缮，进而实现对水利工程最大程度的保护和利用。
2、责权落实、管理分明
小型农田水库工程虽不像大型水利工程具有非常大的施工形式，但其自身也具有一定的施工需求，如何保证施工需求得到满足就成了施工单位的重要工作目标。从目前我国水利工程建设发展来看，将责权落实到个人的方法，取得了不错的效果。一方面，将责权落实到个人，能够使每个人都能明确自己的职责范围和职责行为：另一方面还能够对工程管理人员的工作行为进行监督。实现工程管理质量与个人实际利益相挂钩，进一步激发管理人员的管理责任心和积极态度，为水利工程的有效建设提供客观基础。
3、科学施工、保证质量
在实际施工过程中，为了提高水利工程施工质量，施工单位可以多学习和引进一些先进的施工技术，并对其进行改进和提高，使其能够成为符合水利工程实际需求的施工技术，最大限度地做到量身定做，从而激发出施工技术与实际水利工程之间的火花，提高水利工程的施工质量。与此同时，还要抓好水利工程施工过程中的三检制，按照国家相关规定对水利工程的原材料、中间产品以及施工设备进行试验、检测和验收，严格按照施工工序进行管理，做好单元工程质量的评定工作，切实提高水利工程质量。
4、加大人才培养力度
水利工程要想实现质量的突破与发展，就必须要大量引进专业人才，为此施工单位应提高相应的薪金待遇，以物质基础来促进水利工程人才的引进。与此同时，施工企业要保证每一个工作人员都是持证上岗。对于企业当中部分没有资格证件的人员，企业应组织他们进行相关技能的培训与学习，并参加国家统一资格考试，考试合格后方可继续上岗工作，考试不合格者坚决不予聘用。为了保证工作人员的工作水平始终处于业内领先状态，施工企业还应该定期组织业务技能培训，培训完成后进行统一考核，确保每个工作人员的工作水平都是业内领先状态，并充分地利用他们的专业技术，来实现对小型农田水利工程的管护与整治，切实提高小型农田水利工程的基础作用。