招标文件编制存在招标内容不明确，招标范围不具体，给以后工程造价审计带来不确定因素；
设计施工图缺陷多，甚至边设计边施工，导致施工过程中变更量大，加大了审计工作量和难度。
施工合同的签订不规范、不明确、不严密、造成工程结算审计时难以确定。
施工过程中存在的问题
建设单位不适当的行为增加了审计难度，建设单位一方面与施工单位产生经济上的联系，一方面怕自己工作中存在的问题（包括指定材料供货商）被审计单位察觉，因而不积极主动配合审计，甚至制造障碍影响审计工作的开展。
施工单位投标时采取低价中标，然后再隐蔽工程、现场签证、材料价格上做文章，利用气候、地质条件等自然因素加大索赔，在施工过程中，偷工减料，以次充好，不按设计要求施工，工程量缩水质量达不到设计要求，从而保证盈利要求，从而保证盈利目标，给工程造价的确定带来较大困难。
监理单位的现场代表一般同时监理多个项目，精力投入有限，难以尽职尽责，监理日志不能客观反映工程实施过程的真实情况，当时编造虚假记录或事后补虚假记录。现场签证随意，造成工程造价审计难以深入。
材料价格难以确定，交易方式不规范，市场价格差异悬殊，由于回扣和折扣普遍，原始购货发票难辨真假。
工程造价审计过程中存在的问题
建设单位送审的结算中，施工单位编制结算人员对招投标、合同条款不能完全理解，体现在报送结算时未能按招标以及合同条款执行。
虚量工程量，错套、高套，定额换算错误，只计算变更增项，不扣合同内未做减项，或只减少的不减大的，只减明的，不减暗的，这种减而不全的做法更具有隐蔽性。
施工单位通过各种渠道给审计人员说情、施加压力，乃至威胁，给审计工作带来极坏的影响
应对以上问题，审计人员可以采用以下措施
有条件时审计工作可从项目前期进入，提早介入招投标工作，对招标文件进行审查，确保招标文件的严密性和完备性。加强蓝标价的审核工作。保证拦标价的合理性和准确性。参与招标答疑，对设计施工图中的问题充分提出，尽可能减少设计变更，签订和同时应注意合同的严密性、明确性、具体性审查，对影响工程造价的各项条款把关，特别注意材料价格、取费依据、计价方式，索赔处理等均应做明确处理，为审计工作掌握主动，发挥超前制约功能，更有效地控制和降低工程造价，是审计工作具有连续性。
在施工过程中，深入现场了解各环节情况，进行勘察测量，将各个环节的实施情况与图纸核对，对重点基础数据、隐蔽工程在隐蔽前测量后做好记录，时刻掌握一手资料。为以后工程造价的确定打好基础。
在施工开工时就对施工单位结算相关竣工资料提出要求以及工程造价审计所需提供资料的清单，强调送审资料和完整性和真实性，要求资料及时整理，杜绝补签证的资料的现象，从而保证送审资料的完完整和真实。
加强对材料价格的市场调查，及时掌握市场信息积累资料，逐步建立常用资料，人工，机械的价格库，为工程造价审计工作创造好条件。
对招投标文件、施工合同及补充协议要进行详细研究，对照全过程结算资料，检查是否右前后矛盾，自相矛盾，违背招投标合同承诺内容的计量和支付。
变更签证和费用索赔是工程造价问题发生的高发区和虚增造价的重点，一方面要分析变更签证的真实性、合理性以及索赔形成的的原因，确定索赔条件是否成立，严格审查索赔程序，看索赔事件有无发生的有效证据，并且注意各个环节的具体行为是否按规定程序落实，另一方面审查索赔计算是否正确，包括费用内容和项目合理性，计算准确性。
熟悉图纸，掌握工程计算规则，对整个工程设计和施工要有全面了解，纠正工程量计算出错、错套、高套，定额换算错误等情况。
审计人员自身应有较好的职业道德，较高的敬业精神和较强的社会责任，自觉抵制各种诱惑，赢得信任和尊重。
在审计过程中，用认真 的工作态度，踏实的工作作风，耐心细致的工作方法，热情的服务，公平公正的审计原则，打动被审计方，在建设单位、监理公司以及施工单位建立良好的信誉，使其积极主动配合，变被动为主动，使其审计工作得以顺利进行。