1.整体总承包工程竣工验收合格、总承包人已向发包人移交竣工图、竣工资料和全部钥匙后，支付至工程预结算总价的90%。
解析：如果图纸比较完善，在施工过程中所做的变更洽商较少，那么按预结算总价的百分比支付工程款是可以的，但是如果图纸不完善，特别是一些改造工程，在施工过程中需要根据实际情况调整，甲方也会经常提一些额外的要求，这样会导致变更洽商的增加，如果甲方或监理审核不到位，那么在处理变更洽商的时候就可能会有疏漏，甲方单位很可能会出现金额超付现象，所以对于一些变更洽商比较多的工程，甲方应该按工程合同价支付进度款。这样就对施工单位就显得不是很公平了，这需要双方协商一个妥善的方案。
2.合同价款的调整第X条中约定单项洽商变更项目在3000元以内的不作调整但只做直接费补偿和计取税金，不再计取其他费用。
解析：此处要理解单项的意思，一张变更单中可能会有几条工作内容，也就是有几项内容。因此，这里面说的单项，是一个清单项，而不是一张变更单。例如，一张变更单中有拆除墙体直接费2000元，新增砌筑2500元，那么根据合同，20003000,25003000，这2项费用都是不作调整的，也就是不计取任何费用，直接审减。
3.经监理公司审核并经发包人书面确认的单项洽商变更项目在3000元以内的不作调整，单项洽商金额超过3000元的或单项洽商金额在3000元以内部分累计超过3万元的按实结算。
解析：单项洽商金额超过3000元的或单项洽商金额在3000元以内部分累计超过3元的按实结算。也是举例说明，变更单中的单项目直接费分别为1000元 2000元 2500元 3500元 4500元 20000元这6个金额，那么应该是3500 4500 20000这3个金额大于3000元，超过3000元的金额分别是500元 1500元 17000元，那么分部分项的总费用分别是500元 1500元 17000元，以此为基数进行取费。按第2条的原则处理，1000 2000 2500这3个金额均小于3000元，并且累计金额不超过3万元，毫无争议的审减。
总结：如果合同中出现第2条 第3条的情况，那么在实际施工中，应该是小于3000元的变更做在一起，如果分部分项费用是45000元，那么扣除30000元，可以拿到15000元+取费。不按这种方法做变更单，那么你低于3000元的全部作废，没有意义。
4.措施项目中的模板量按实际发生调整，单价执行综合单价，以项目为计量单位的计价措施，项目费用固定包死。
解析：在QQ群里有一个朋友问冬季施工费该采购哪些物资，并且管甲方要钱。如果你的承包合同中签到的是以项目计量的计价措施，项目费用固定包死，你采取的冬季保护措施不管有多少，你也是要投标时候的那些钱，所以这就说明合同的重要性了，不然钱白花。
5.实际施工时，钢筋/钢材及人工市场价格及机械价格超出开标当月信息价5%时，超出部分予以调整。
解析：这条同样说到是超出部分予以调整。投标时候人工价格是100元/工日，实际施工时人工价格为115元/工日，那么超出是10元，而不是15元。
6.合同内有原单价的，执行原合同价格，和合同内单价接近的，参照合同价；合同内无单价的，施工方上报价格，由发包人审核。
解析：举例说明，有一个工程，其中单位单位工程有2个，这2个工程中都有墙体砌筑这个清单项，但是投标的时候没有进行统一调整材料价，或者是针对不同单位工程，采取了分别报价的原则，最后导致的就是综合单价不一致，那么如果你的变更洽商中有墙体砌筑的情况下，审计单位是要按照2个单位工程较低的综合单价给你计算费用的。
对于新增清单项，或者是洽商项目，涉及材料的变更，需要重新组价，那么应该是项目在施工过程中就已经要进行材料认价，让甲方给签字确认材料采购单价，否则在结算时再办理的话会很耽误时间。