绿地排水
屋顶花园绿地排水有内、外排水之分。外排水是指绿地培植土过饱和的水分直接排到屋面，这种方式经济、简单，但容易污染屋面。内排水则是把绿地培植土过饱和的水分经过滤后排到天沟或通入室内排水系统。
过滤排水
培植土里过饱和的水分经过滤层和排水层过滤后排出屋顶花园。排水过滤层要能隔住细粒的培植土以免流失。排水过滤层材料要渗透性好,不易碎裂，耐冲击,不易风化,而且质量轻,可用矿棉布、黑麦杆和泥炭等。排水层材料应选择质轻、耐久、易铺设的材料。如膨胀粘土、火山渣、卵石、砾石等。
安排培植土层
屋顶花园
培植土的厚度一般取决于承重楼板的允许荷载，并考虑所用材料的容重和维护绿化的状况。经常行走的草坪土层厚度一般为20～25厘米；灌木土层厚度为40～50厘米;乔木土层厚度为110厘米。用乔木绿化，培植土要有适当的体积，这比适当的厚度更为重要。有时可把草坪、灌木和乔木的培植连起来，作成小土坡。为了尽量减轻培植土的重量，并有利于植物的生长，培植土里要掺入减轻培植土重量的材料，如泡沫塑料制品、珍珠岩等。
设置水池
屋顶花园水池多是浅水池,水深一般为30～50厘米。屋顶花园水池的进水、排水、溢流、循环水等工程和地面花园水池的基本相同。屋顶水池壳筑在结构板面、防水层和保护层的上面，一般为钢筋混凝土结构，也可采用玻璃钢等材料以减轻重量。由于池壳一般是筑在平屋顶上的，所以池壁与屋顶平面形成一定高差,为了使水池和周围环境自然结合,可在池边盖架空板或填上轻质混凝土以平池岸，收贴水景效；也可结合池壁组织绿化或砌筑坐椅。也有在水池驳岸砌景石，塑树桩、竹桩或濒临水际铺卵石滩，以增加野趣。