工程变更控制和管理应遵循这样几个原则：工程变更管理应依据施工承包合同，纳入到合同管理的日常工作中；工程变更必须遵守设计任务书和初步设计审批的原则，符合有关技术标准、设计规范，符合节约能源及环保的要求、提高工程质量、方便施工、利于使用、节约投资、加快施工进度的原则；变更设计必须在承包合同文件的约束下进行，任何变更均不能使原承包合同失效；工程变更应及时、正确处理，避免引起工程纠纷和扯皮。
工程变更的范围和内容很广泛，也比较复杂，诸如增加或减少合同中任何一项工作内容；增加或减少合同中关键项目的工程量超过一定的百分比；取消合同中任何一项工作；改变合同中任何一项工作的标准或性质；为完成工程追加所需要的任何额外工作。等等。也就是说，工程变更不只是图纸内容的改变，如材料替换、设备参数修改、施工方法的改变、功能调整、尺寸变化等均属于工程变更的范畴。
而从变更的性质来说，工程变更包括设计变更、进度计划变更、施工条件变更和现场签证变更等。在项目投资控制的实际操作过程中，主要有这样几种工程变更的形式：施工单位提出的工程变更；施工单位对图纸或设计说明有不明确的问题向设计单位提出询问；施工单位提出技术修改，如对某些材料、设备参数的选用提出变更请求；施工单位对施工方法提出修改；施工单位要求修改图纸；施工单位往往还会因材料采购，资金安排和人力组织方面的原因而提出变更施工组织设计中施工方案的要求。监理工程师在施工过程中对发现的问题，提出工程变更的合理建议。还有在施工过程中，设计单位或其驻工地代表对原设计中存在的错、漏、碰、缺提出设计修改和完善意见。以及业主为考虑市场因素，完善使用功能，或为了保证工程质量、降低工程造价，加快工程进度等原因，提出工程变更的要求。
工程变更中，变更价款是非常敏感的，也在很大程度上影响到各方利益。对工程价款的变更，应该特别慎重。因为这里首先涉及的是工程造价控制，而工程变更控制是工程实施阶段造价控制的主要内容，工程变更价款的确定，同合同清单价格的编制和审核基本相同。所不同的是，由于在施工过程中情况发生了某些新的变化，应该针对工程变化的特点，采取有效的预防措施，做到主动控制和事前控制，处理工程变更价款，为确保投资效益奠定坚实的基础。
工程变更价款的确定仍应根据原计价方式和合同文件的约定以及有关的规定来办理，但要特别强调手续齐全、资料详实、符合编制工程变更价款的有关规定、及时处理等几方面问题，尤其是要及时处理。因为工程变更是一个动态管理的过程，变更价款的确认应在变更发生后规定的时间内办理。有些工程子目在完工之后或隐蔽在工程内部，或已经不复存在，若不及时审核就会给工程变更价款的确定带来困难。
在工程施工过程中，引起工程变更的原因很多。如何减少工程变更，首先应严禁通过工程变更扩大建设规模，提高设计标准，增加建设内容，除非不变更会影响项目功能的正常发挥，或使项目无法继续进行下去。其次，认真处理必须发生的工程变更，对于涉及到费用增减的设计变更，必须经设计方、业主方、总监理工程师共同签字方为有效。考虑到项目的重要性，造价管理专业人员应常到施工现场，随时掌握及处理工程造价的变化情况。
毫无疑义，工程变更的管理措施必须有力并且得当。笔者认为，除对施工承包合同所对应的工程质量、进度、造价组成内容进行必要的审查和确定、施工组织设计所涉及的相关费用的审查和确定。例如，属于技术措施费的打桩工程释放孔、防震沟、人工降效等和属于安全施工措施费的防护栏杆、成品保护等费用，由于技术措施费、安全施工措施费等在投标报价时均以包干形式综合考虑，一般包括在承包合同的基本措施费用（开办费）中，不允许再以变更/签证的形式重复计取，防止在实际施工过程中施工单位有意无意地浑水摸鱼等情况外，严禁工程变更内容在未得到书面确认前，就已经开始施工造成既成事实。完善现场签证手续，在工程变更隐蔽前，必须经监理、业主及施工三方会签，力求做到所签证内容、工程量与现场变更情况一致，这样操作也可避免发生索赔与纠纷。对工程变更应做到事前把关、主动监控和规范操作。
还要加强设计变更控制，无论是总价合同、单价合同还是成本加酬金合同，一旦发生工程变更，将不可避免地使工程造价和工期发生变化。因此，在变更审批时，要进行技术经济分析，检查变更的理由、依据、单价、数量和总价的变化情况，确认变更不会从根本上影响工程质量、工期以及投资控制目标。
为了对工程变更进行有效的控制和管理，除应加强工程变更的有效性、符合性及单价合理性分析外，还应结合投资控制目标，注意由变更引起的其它索赔和反索赔的可能性，并努力确保工程造价的公平性和合理性。